El Museo de Arqueología Shisanhang está situado prácticamente en la esquina sur donde desemboca el río Tamsui, Distrito de Bali, en la Ciudad de Nueva Taipéi. Las primeras instalaciones del sitio son de 1998 y en principio se conocía como Sala de exposiciones de reliquias culturales del sitio de Shisanhang, literalmente 13 hang (十三行), que podría significar 13 casas comerciales, refiriéndose a un sitio comercial antiguo del lugar, ya que era un puerto. Fue organizado como museo el 24 de abril del 2003 y pasó a llamarse Museo Shisanhang del Condado de Taipéi, y luego se cambió a su nombre actual en el 2010.
Con el objetivo de preservar y promover la cultura prehistórica del sitio de Shisanhang, el Museo de Arqueología Shisanhang espera aumentar la conciencia de los ciudadanos sobre la preservación de los acervos culturales. Con los cambios sociales, el Museo de Arqueología Shisanhang no sólo asume la responsabilidad de pasar el patrimonio cultural a las futuras generaciones, sino también tareas importantes como la arqueología, la etnología y la antropología.
La cultura relacionada con los artefactos antiguos que se encontró en el lugar pertenece a la Edad de Hierro del norte de Taiwán, entre 1800 y 500 años y hasta ahora son los únicos habitantes de ese periodo que contaba con tecnología para fabricar hierro. El sitio arqueólogo de Shisanhang fue descubierto en otoño de 1955, cuando el comandante de la Fuerza Aérea Pan Ko-yung sobrevoló el monte Guanyin y descubrió que la brújula de su avión tenía fuertes oscilaciones por una fuerza magnética, por lo que dedujo que podría haber depósitos de hierro a gran escala en el área. Así, Pan, el geólogo Lin Chao-di y otros vinieron a explorar este sitio. Se pudieron ver bloques de hierro por todas partes en el sitio. Al mismo tiempo, también se encontraron muchas reliquias, como piezas de cerámica prehistórica, piedras talladas (石支腳) y piedras cóncavas redondeadas más pequeñas utilizadas como herramientas (凹石), entre otras. Con tales reliquias se formó un sitio histórico.
Debido a la construcción de la planta de tratamiento de aguas residuales del Distrito de Bali, entre 1989 a 1992, dado que iba a instalarse en el sito histórico atrajo la atención de todos. Las áreas departamentales y ministerios del Gobierno Central decidieron asignar terrenos de la planta para establecer un museo con casi cuatro hectáreas de edificios y plazas, incluyendo el complejo de edificios del museo, salas de exposiciones permanentes de las reliquias culturales desenterradas del sitio, una sala de exposición especial y una sala de experiencias de aprendizaje arqueológico. Además, en el mismo sitio se presenta elementos arqueológicos de jardín botánico (植物園文化) y el sitio arqueológico de la cultura Yuanshan (圓山文化).
Entre las reliquias culturales desenterradas del sitio arqueológico Shisanhang, la mayoría son cerámicas. Entre ellas, hubo alrededor de 126 piezas de artefactos cerámicos completos o recuperables, y se estimaron más de 800.000 piezas rotas. Entre los artefactos cerámicos desenterrados, el más llamativo es una vasija de cerámica con rostro humano (人面陶罐), que es el tesoro del museo Shisanhang. Los patrones decorativos, como círculos realizados con tallos secos (de arroz o junco) y patrones de punto, se distribuyen uniformemente en la superficie de la boca y las patas de la vasija, y hay un rostro humano vívido en el vientre de esta. Además, en el sitio de Shisanhang también se desenterraron muchas cuentas de ágata, pulseras de vidrio y de otros materiales.
El Museo de Arqueología Shisanhang fue diseñado por el arquitecto taiwanés Sun Te-hung. El concepto de diseño arquitectónico se inspiró en las excavaciones arqueológicas y los antepasados que llegaron a Taiwán en barco. Todo el museo está compuesto por tres grupos de edificios y con las imágenes de la montaña y mar junto al pasado y el presente. El museo está construido con hormigón, piedra arenisca y placas metálicas de aspecto envejecido. Todo el edificio está en un desnivel a 1,5 metros bajo tierra. Antes de entrar en el museo, los visitantes pasan por una rampa que hacia arriba y luego levemente inclinada hacia abajo, lo que simboliza que se va a experimentar un viaje a tesoros arqueológicos encontrados bajo tierra..
Las partes más populares del museo son la "plataforma de observación de las dunas de ballenas" (鯨背沙丘瞭望臺) y la "torre octogonal arqueológica" (考古八角塔) que está inclinada. La primera simboliza la espalda de ballena en el mar y las dunas de arena donde vivían los habitantes de la cultura del sitio Shisanhang en ese momento. Los visitantes pueden subir las escaleras fuera del museo para ver la hermosa puesta de sol, el río Tamshui y la monte Guanyin. La mencionada torre inclinada simboliza las ruinas de la destrucción y la verdad histórica que no se puede corregir.
Desde su creación, el museo ha ganado muchos premios. En el 2002, ganó el primer premio del Taiwan Architecture Prize; en el 2003, ganó el Far Eastern Architecture Awards; y en el 2014 ganó el Golden Lion Award para cultura y educación en el National Architecture Golden Award de Taiwán.