Chen Yu-hsun nació en Taipéi en 1962. Obtuvo un título de grado en Educación y ciencia de la Información (ahora Bibliotecas y ciencia de la información) de la Universidad Tamkang. Durante su adolescencia, sus padres querían que se graduara de la universidad, encontrara un trabajo como docente o en la administración pública y llevara una vida agradable y estable. Sin embargo, Chen no tuvo el desempaño académico que hubiera querido en la escuela secundaria superior. Eso lo deprimió y lo llevó a interesarse más en la música rock que en sus estudios. Después de fallar en el examen de ingreso a la universidad, fue a cumplir su servicio militar.
Durante su servicio en el ejército, Chen se encontró con compañeros de diferentes orígenes, circunstancias e identidades, y comenzó a desarrollar un interés por las personas y los personajes. Después de ingresar con éxito a la universidad, se ofreció como voluntario para trabajar como asistente de estudio para el Departamento de Comunicación Masiva. Esto lo llevó a una oportunidad de pasantía en una empresa de la industria cinematográfica: Minxin Studio (民心工作室) del director Wang Shau-di y al descubrimiento del verdadero amor de su vida: contar historias a través de imágenes.
Después de graduarse, Chen pasó a trabajar en dramas de televisión y se desempeñó como guionista y director de series locales de Taiwán. Entre otras, se incluyen 母雞帶小鴨 (La gallina trajo un patito ) y 納桑嘛谷－我的家 (Ngasal Maku — My Home). En 1993, la Oficina de Información del Gobierno lanzó un programa de incentivos y Chen obtuvo una beca del gobierno que le posibilitó ser director de un cortometraje con un guion escrito por él. Dos años más tarde, hizo su debut cinematográfico con熱帶魚 (Tropical Fish). Era una película de drama y comedia, incluso con secuestradores que parecían agradables, pero en medio de las risas, también se revelan problemas de la sociedad taiwanesa de la época.
A finales de la década de 1980, la industria cinematográfica de Taiwán estaba en declive, con una producción que disminuía y nadie estaba dispuesto a invertir en películas nacionales. Como resultado, la carrera de producción cinematográfica de Chen también se vio afectada. Después de completar su segunda película 愛情來了(Love Gogo) en 1997, Chen dejó de hacer películas durante bastante tiempo e incluso pasó un par de años sin trabajo. En una entrevista reciente con los medios de comunicación, Chen reveló que era tan pobre que sus ingresos durante todo un año fueron de sólo NT$80.000. Durante diez largos años sin trabajar en el cine, se dedicó a filmar publicidades, realizando una serie de anuncios entretenidos y muy recordados. En 2013, hizo su regreso al cine con總鋪師 , titulada en inglés como Zone Pro Site, una película del género de comedias, enfocada en unos personajes de una pequeña tienda de comidas de platos típicos de Taiwán, participan en una importante competencia culinaria. Tal película fue un éxito de taquilla y consagró a Chen.
Tanto en "Tropical Fish" como en "Love Gogo", está claro que Chen tiene un talento particular para las comedias centradas en la gente común, enfocándose en la fuerza simple de cada personaje que se muestra a través de los sentimientos más cercanos a él: amor, parentesco, y amistad. Los anuncios que filmó estaban llenos de un sentido del humor distintivamente taiwanés, y ha mostrado un don para resaltar las cualidades cómicas particulares de sus actores. Por ejemplo, la actriz de comedia Lin Mei-hsiu en realidad comenzó como actriz de teatro, pero gracias a sus participaciones en publicidades de pastillas a base de hierbas, rápidamente se convirtió en una celebridad famosa.
Chen, quien es considerado genio de comedia, ha comentado que el público en general tiende a tratar la comedia a la ligera como una forma de hacer reír pero sin nada sustancial que ofrecer, pero Chen no se considera "simplemente" director de comedia. En el pasado, manifestó, dado que no quería presentar historias trágicas que depriman a la audiencia, recurrió a la comedia para poder presentar historias "trágicas" a través del humor. Su objetivo es brindarle a su audiencia un momento cómodo y divertido cuando ven sus películas y, al mismo tiempo, darles algo de que aprender.
A lo largo de sus 32 años en el cine, Chen ha sido nominado a varios premios, incluido el Leopardo de Oro en el Festival Internacional de Cine de Locarno y el Caballo de Oro al Mejor Guión Original en 1995, así como el Premio al Mejor Guion de la Oficina de Información del Gobierno en 1996.
En 2020, casi una década después de su última película, Chen regresó con消失的情人節 (My Missing Valentine). Con un guion que se había estado gestando durante unos 20 años, la película se llevó 11 premios, incluyendo al Mejor Largometraje, Mejor Director, Mejor Guion Original, Mejores Efectos Visuales y Mejor Edición en la 57ª edición de los Premios Caballo de Oro.
Cuando se le preguntó en una entrevista sobre su futura dirección como director, Chen dijo que sentía que se estaba haciendo viejo y que, dado que hacer películas requiere mucha capacidad intelectual, resistencia física y pasión, no estaba seguro de poder continuar en la industria del cine. Sin embargo, si tiene la oportunidad, estaría interesado en probar suerte en un thriller de misterio, lo que sería un nuevo desafío para él.