当博物館では以下の業務を行っています。
一、台湾の自然史と文化史の調査、収集、研究。
二、収蔵制度の策定、収蔵品の管理保護、保存修復。
三、展示スペースの開発や環境の監視・コントロール、展示テーマの企画、設計、実施、管理維持。
四、教育の推進、マーケティング、広報、国内外の博物館との交流・協力、ボランティアの管理、公共サービス。
五、館内所蔵の史料や図書、影像資料の管理、デジタル活用、出版。
六、このほか、台湾の自然史と文化史に関する業務。